Se establece una primera fase de acreditación institucional inicial y, antes del transcurso de seis años una renovación de dicha acreditación.
Para desarrollar la labor de evaluación, ANECA aprovecha las sinergias de la acreditación de los títulos (que en ANECA se lleva a cabo a través del programa ACREDITA), con las del proceso de certificación de la implantación de los sistemas de garantía internos de calidad. ANECA realiza la certificación de la implantación de dichos sistemas a través del programa AUDIT) .