- El ministro de Educación (Ángel Gabilondo Pujol), a quien corresponde la presidencia del Patronato.
- El secretario general de Universidades (Marius Rubiralta i Alcañiz).
- La subsecretaria de Educación (Mercedes López Revilla).
- El director general de Política Universitaria (Juan José Moreno Navarro).
- El director general de Investigación y Gestión del Plan Nacional de I+D+i (José Manuel Fernández de Labastida y del Olmo).
- El coordinador general de la Comisión Nacional Evaluadora de la Actividad Investigadora (Alfredo Poves Paredes).
- Subsecretaria de Economía y Hacienda (Juana María Lázaro Ruiz).
- Subsecretario de Política Territorial (Juan Antonio Cortecero Montijano).
- Subsecretaria de Sanidad y Política Social (Consuelo Sánchez Naranjo).
Serán también miembros del Patronato tres rectores nombrados por la ministra de Ciencia e Innovación, a propuesta del Consejo de Universidades, y tres de los responsables de la enseñanza universitaria en los Consejos de Gobierno de las Comunidades Autónomas, nombrados por la Conferencia General de Política Universitaria.
Actualmente, por parte de los rectores, son patronos:
- Federico Gutiérrez-Solana Salcedo, rector de la Universidad de Cantabria.
- Adelaida de la Calle Martín, rectora de la Universidad de Málaga.
Y por parte de los responsables de la enseñanza universitaria en los Consejos de Gobierno de las Comunidades Autónomas, son patronos:
- Juan José Mateos Otero, consejero de Educación de Castilla y León.
- Jose Luis Iglesias Rioprede, consejero de Educación y Ciencia del Principado de Asturias.
Asimismo podrán ser miembros del Patronato hasta cinco personalidades de reconocido prestigio en la vida académica, científica, profesional, social, económica o cultural, nombradas por la ministra de Ciencia e Innovación. Actualmente, son patronos:
- Josep Mª Bricall i Masip, catedrático de la Universidad de Barcelona.
- Daniel Innerarity Grau, catedrático de Filosofía e Investigador Ikerbasque en la Universidad del País Vasco.
- Enric Isidre Canela Campos, catedrático de la Universidad de Barcelona.
- Antonio Pascual Acosta, catedrático de la Universidad de Sevilla.
